Начальник научно – исследовательского сектора КБГАУ. Является членом диссертационного совета по защите докторских и кандидатских диссертаций

Д 220.033.02 при КБГАУ им. В.М. Кокова. Заведующий Проблемной научно-исследовательской лабораторией орнитологии и болезней птиц.

Основное направление научных исследований: «Биоэкологический мониторинг в птицеводстве, орнитофауна, экология паразитозов птиц, ассоциативные болезни животных и птиц и их интегрированная профилактика». Возглавляет научную школу по проблеме «Симбиоценозы и паразитоценозы животных и птиц». Под руководством Кожокова М.К. защищены 5 кандидатских диссертаций и в настоящее время он осуществляет научное руководство 2 аспирантами и 2 докторантами, 2 соискателя. Имеет около 228 опубликованных научных работ, в том числе монографии: «Проблемы симбиоценологии», «Криптоспоридиоз птиц – важнейший зооноз», «Симбиоценозы птиц».

За многолетнюю плодотворную работу по развитию и совершенствованию учебного процесса награжден Почетными грамотами МОН КБР, МСХиП КБР и Российской Федерации.

Читает курс «Паразитоценозы КБР» и «Болезни птиц» на факультете ветеринарной медицины.